Sofern du kein /templates_c mehr hast, also mit einer neueren GX-Version arbeitest, reicht es m.E. /cache/smarty/ zu leeren.
Ein mögliche Erklärung wäre noch hard gecodete Links in der Datenbank und in den Dateien, auch USERMODS und überladene Dateien. Die solltest du alle mal nach alten bzw falschen Links durchsuchen.